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本题考查的是概念的关系。题目中，美国是美洲国家中的一个，二者逻辑关系属于真包含于关系。A项中，黑色是颜色的一种，二者的逻辑关系也属于真包含于关系，与题目中概念关系相同。综上所述，A项正确。

B项，动物和植物都属于生物，生物包括动物、植物、细菌、真菌等等，动物和植物的外延完全不同且外延之和小于生物的外延，二者的逻辑关系属于全异关系中的反对关系。与题干中的概念的关系不一致，排除。

C项，汽车是交通工具的一种，二者的逻辑关系属于真包含关系。与题干中的概念的关系不一致，排除。

D项，有的学生是党员，有的党员是学生，二者的逻辑关系属于交叉关系。与题干中的概念的关系不一致，排除。

因此，本题正确答案为A。