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　　(1)氨中毒学说：一般认为，氨的毒性作用是干扰脑细胞的三羧酸循环，使大脑细胞的能量供应不足，以致不能维持正常功能。

　　(2)假性神经递质学说：肝功能衰竭时，食物中的芳香族氨基酸，如酪氨酸、苯丙氨酸等，在肝内清除发生障碍而进入脑组织，形成异常的β羟酪胺和苯乙醇胺;后两者的化学结构与正常神经递质去甲肾上腺素相似，但几乎不能传递神经冲动，故称为假性神经递质。它们取代了突触中的正常递质，使神经传导发生障碍而出现意识障碍和昏迷。

　　(3)γ-氨基丁酸/苯二氮䓬(GABA/BZ)复合休学说：GABA受体和其他两个受体蛋白即BZ受体和巴比妥受体紧密相连，组成GABA/BZ复合体，三者中的任一种和受体结合后起抑制作用，引起神经传导抑制。

　　(4)氨基酸代谢不平衡学说：肝硬化患者血浆芳香族氨基酸增多而支链氨基酸减少，两组氨基酸呈代谢不平衡现象，脑中增多的色氨酸衍生出更多的5-羟色胺，后者有拮抗去甲肾上腺素的作用，可能与昏迷有关。