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具体而言，ABS与BOT融资方式在项目所有权、运营权归属、适用范围、对项目所在国的影响、融资方式、风险分散度、融资成本等方面都有不同之处。

(1)项目所有权、运营权归属。BOT融资方式中，项目的所有权与经营权在特许经营期内是属于项目公司的，在特许期经营结束之后，所有权及与经营权将会移交给政府；在ABS融资方式中，根据合同规定，项目的所有权在债券存续期内由原始权益人转至SPV，而经营权与决策权仍属于原始权益人，债券到期后，利用项目所产生的收益还本付息并支付各类费用之后，项目的所有权重新回到原始权益人手中。

(2)适用范围。对于关系国家经济命脉或包括国防项目在内的敏感项目，采用BOT融资方式是不可行的，容易引起政治、社会、经济等各方面的问题；在ABS融资方式中，虽在债券存续期内资产的所有权归SPV所有，但是资产的运营与决策权仍然归属原始权益人，SPV不参与运营，不必担心外商或私营机构控制，因此应用更加广泛。

(3)资金来源。BOT与ABS融资方式的资金来源主要都是民间资本，可以是国内资金，也可以是外资，如项目发起人自有资金、银行贷款等；但ABS方式强调通过证券市场发行债券这一方式筹集资金，这是ABS方式与其他项目融资方式一个较大的区别。

(4)对项目所在国的影响。BOT会给东道国带来一定负面效应，如掠夺性经营、国家税收流失及国家承担价格、外汇等多种风险，ABS则较少出现上述问题。

(5)风险分散度。BOT风险主要由政府、投资者／经营者、贷款机构承担；ABS则由众多的投资者承担，而且债券可以在二级市场上转让，变现能力强。

(6)融资成本。BOT过程复杂、牵涉面广、融资成本因中间环节多而增加；ABS则只涉及原始权益人、SPV、证券承销商和投资者，无须政府的许可、授权、担保等，采用民间的非政府途径，过程简单，降低了融资成本。